La Carrera de Derecho de la Facultad de Ciencias Jurídicas de la U.N.I. fue habilitada en fecha 15 de julio de 2003 por Resolución Nº 021/03 del Consejo Superior Universitario de la Universidad Nacional de Itapúa y avalada por el Consejo de Universidades, según Acta Nº 116 de fecha 30 de diciembre de 2003.
El Plan de Estudios de la Carrera de Derecho presenta una duración de 5 años, con 5.400 horas de 40 minutos, equivalentes a 3600 horas de 60 minutos, más un Curso Preparatorio de Ingreso con una duración de cinco meses.
El 04 de agosto de 2003, se inicia el primer Curso Preparatorio con 104 postulantes, de los cuales ingresaron 80, más 9 con ingreso directo, por ser profesionales egresados de otras Carreras universitarias, quienes acceden al curso regular directamente, conforme a lo dispuesto en el artículo 3º inciso d) del Reglamento del Curso Preparatorio de Ingreso.
En la segunda quincena del mes de diciembre del año 2.003, se ha procedido a la elección de Profesores Encargados de Cátedras, previo análisis del plantel de Recursos Humanos disponibles en la Facultad. En fecha 28/03/2005, según Acta Nº 139 del Consejo de Universidades se habilita la Carrera de Derecho en la Sede de Natalio. Por Acta Nº 10 de fecha 30/10/2006 el Consejo de Universidades aprueba la habilitación de la Carrera en el Distrito de Tomás Romero Pereira, ciudad de María Auxiliadora.
La Facultad de Ciencias Jurídicas de la Universidad Nacional de Itapúa, cuenta en la actualidad con más de 871 estudiantes, distribuidos en las tres sedes; Encarnación, Natalio y María Auxiliadora. En el año 2009 egresaron los primeros 25 Abogados en Encarnación.
La oferta académica de esta Facultad incluye además de la Carrera de Derecho la de Notariado aprobado por Resolución Nº 45/14 del Consejo Nacional de Educación Superior (CONES) y diversos programas de postgrado también habilitados por el CONES.